แม้ว่ารากฟันเทียมจะมีลักษณะและความรู้สึกเหมือนกับฟันจริงตามธรรมชาติ แต่ในความจริงแล้ว รากเทียมและเหงือกไม่ได้เกิดการหลอมหลวมเป็นเนื้อเดียวกันเหมือนกับฟันตามธรรมชาติ แทนที่จะฝังอยู่ในเหงือกเหมือนฟันธรรมชาติ สะพานฟันจะวางอยู่บนเหงือกและปล่อยให้แบคทีเรียสามารถเกาะอยู่ระหว่างฟันปลอมและเหงือกได้ อาจทำให้เกิดภาวะแทรกซ้อนลึกลงไปถึงกระดูกขากรรไกรได้หากไม่ได้รับการทำความสะอาดที่ดี แบคทีเรียสามารถสะสมอยู่ที่ฐานของรากฟันเทียมซึ่งอาจส่งผลให้เกิดโรครอบฟันเทียม (peri-implant disease) เยื่อเมือกอักเสบรอบรากฟันเทียม (peri-implant mucositis) คือการอักเสบของเหงือกและเยื่อเมือกรอบรากฟันเทียมโดยไม่มีการสูญเสียกระดูกที่รองรับ และหากถูกวินิจฉัยและได้รับการรักษาช้าเกินไปก็อาจจะส่งผลให้พัฒนาเป็นการอักเสบรอบรากฟันเทียม (peri-implantitis) ซึ่งนอกจากจะเป็นการอักเสบของเหงือกและเยื่อเมือกรอบฟันเทียมแล้วยังจะมีการสูญเสียกระดูกที่รองรับร่วมด้วย